天空被绝望笼罩，地面沦为怪物的猎场。幸存的人类在云端筑起浮空堡垒，依靠魔法战士——空战魔导士守护最后的希望。曾经被誉为"黑之剑圣"的彼方·英司，从云端跌落泥潭，背负着叛徒的污名，在唾弃与鄙夷中苟活。命运却开了一个残酷的玩笑，将这位昔日的王牌派往全学园最弱小的E601小队担任教官。那里聚集着三个被所有人放弃的问题少女，她们是学园
