在蔚蓝湘南海岸的江之岛，私立江之岛学园汇聚着全国精英少年。当サッコ、リミヤ、トシ被选入特殊强化班级"エレメント"时，他们未曾想到命运正等待他们。这些年轻人被迫驾驭依靠情感驱动的"ベクターマシン"，迎战来自远古的神秘侵略者"神話獣"。战火纷飞中，サッコ被奇异幻象引导，喊出震撼宇宙的召唤："想星合体！GO、アクエリオン！"
